Michaela Kratzer studierte Bühnen- und Kostümgestaltung sowie Film- und Ausstellungsarchitektur am Mozarteum Salzburg. Sie assistierte am Schauspielhaus Bochum und dem Schauspiel Frankfurt, wo eigene Arbeiten mit Martina van Boxen, Pedro Martins Beja und Martina Droste entstanden. Darüber hinaus arbeitet sie am Schauspiel Bonn und den Staatstheatern Darmstadt und Braunschweig. Mit der Regisseurin Laura Linnenbaum verbindet sie eine langjährige Zusammenarbeit.
In der Spielzeit 2021/22 entwirft sie am Schauspiel Hannover die Kostüme für Fokus in der Regie von Laura Linnenbaum.